学园都市制宇宙升降机「恩底弥翁(Endymion,希腊神话中的恩底弥翁:埃特里俄斯俊美的儿子,为月亮女神塞勒涅所钟爱。)」。就在这个设施即将完成之际,上条与茵蒂克丝同无能力者(LEVEL0)少女·鸣护阿莉莎相遇了。茵蒂克丝与阿莉莎在名为「旺盛食欲」的谜团上找到了共同语言,因此意气相投。就在三人于放学后游玩时,遭遇了带着魔法师而来的史提尔发起的突然袭击。其目标,便是阿莉莎。为什么身为科学侧一方的她会遭遇魔法侧的袭击?在遭遇魔法侧强袭后,学园都市一侧,女性领袖·夏特阿舞拉所率领的安保部队展开了行动。就在上条与...